Указом Президиума Верховного Совета СССР от 21.06.1946 года «О порядке образования судов и рассмотрения судами дел в Кенигсбергской области» было установлено, что впредь до избрания на территории Кенигсбергской области Советов депутатов трудящихся народные судьи допускались к исполнению обязанностей Министром юстиции РСФСР.
Решением Исполкома Калининградского областного Совета депутатов трудящихся от 03.10.1947 года № 304 утверждена сеть народных судов в Калининградской области на 1948 год в количестве 28 участков, в том числе Народный суд г. Балтийска.
Решением Исполкома Балтийского городского Совета депутатов трудящихся от 12 ноября 1947 года в должности народного судьи г. Балтийска был утвержден Черяпкин Василий Андреевич, 1921 года рождения.
В годы войны Василий Андреевич работал военным следователем, в 1952 году он продолжил трудиться в должности заместителя начальника Управления МЮ РСФСР в Калининградской области.
В декабре 1952 года народным судьей г. Балтийска была избрана Зоя Сергеевна Цветкова, ее заслуги неоднократно отмечались руководством Управления МЮ и областного суда. Немаловажную роль в достижении высоких результатов деятельности сыграл предшествующий опыт ее работы в органах юстиции БССР, куда она была направлена по окончании Ташкентского юридического института. В Народном суде г. Балтийска Зоя Сергеевна проработала до 1960 года.
С 1961 года Народный суд г. Балтийска был переименован в Балтийский городской народный суд, и в течение последующих пяти лет правосудие осуществляла Лариса Федоровна Дашко.
С 1965 года в течение 11 лет народным судьей была Мария Ивановна Сучёва. Эта женщина с судейским стажем в четверть века и колоссальным жизненным опытом оставила яркий след в судьбе не одного работника судебной системы Калининградской области. Марина Ивановна, являясь единственной судьей района, с достоинством выполняла возложенные на нее обязанности, в числе которых - участие в товарищеских судах, отчеты перед избирателями, работа с народными заседателями, правовая пропаганда. Среди дел того периода преобладающее большинство составляли дела по хулиганству. В 1976 году с должности председателя Балтийского городского народного суда она ушла в почетную отставку.
На смену председателя суда М.И. Сучёвой в 1976 году пришел молодой судья Виктор Сергеевич Осипов. Дела он принимал от народного заседателя Нелли Ивановны Медецкой, которая исполняла обязанности судьи. К тому времени в его послужном списке значились работа в транспортной прокуратуре и деятельность в должности начальника Багратионовского таможенного поста. Позже Виктор Сергеевич перевелся в г. Балтийск, где получил предложение участвовать в выборах на должность судьи города.
Здание суда тогда все еще размещалось на ул. Гагарина. На протяжении 40 лет – с 1947 до середины 80-х годов - комнаты немецкого дома превратились в служебные кабинеты для сотрудников суда. Виктор Сергеевич самостоятельно приводил его в порядок. В 1987 году, когда Министерство юстиции в очередной раз не выделило средств на ремонт здания, он подготовил документы для рассмотрения на собрании депутатов вопроса о предоставлении суду нового здания. В середине 80-х годов увеличение штатной численности привело к переезду в новое здание по ул. Ленина, д. 40. Через десять лет суд въехал в двухэтажное строение, расположенное на ул. Садовой, д. 55, где и находится по настоящее время.
Виктору Сергеевичу приходилось часто заменять судей в сопредельных Зеленоградском и Светловском районах, при этом каждый вечер он должен был возвращаться в г. Балтийск, чтобы контролировать работу своего суда. Но рядом всегда были надежные и отзывчивые коллеги, в первую очередь зональные судьи областного суда Валентина Александровна Кузовенко и Людмила Ивановна Долгова, каждая из которых всегда находили время, чтобы помочь разобраться в любом правовом вопросе.
Кроме того, в суде имелись проблемы, связанные с нехваткой работников аппарата. Так, например, народных заседателей приходилось привлекать к исполнению обязанностей секретарей судебных заседаний. А некоторые архивы города по сей день хранят исполнительные листы, выполненные собственноручно председателем суда г. Балтийска.
Собственная нагрузка Виктора Сергеевича была ничуть не меньше, а условия, в которых иной раз приходилось работать, оставляли желать лучшего. Так однажды ему пришлось проводить выездное заседание практически в потемках. Дело тогда было рассмотрено в клубе, отапливаемом печуркой, под освещение керосиновой лампы. Но он никогда не сетовал на трудности, поскольку с самого детства привык к спартанским условиям и постоянным спортивным нагрузкам.
В 1994 году был образован Балтийский городской суд Калининградской области. Основными задачами суда являются: направление деятельности суда на осуществление правосудия, на всемерное укрепление законности и правопорядка, предупреждение преступной и иных правонарушений.
В целях обеспечения работы суда по осуществлению правосудия действует аппарат суда, который подчиняется председателю суда.
Председатель суда председательствует в судебных заседаниях, распределяет обязанности между судьями, руководит работой аппарата суда. Городской суд в пределах своей компетенции рассматривает дела в качестве суда первой инстанции и осуществляет другие полномочия, предусмотренные федеральным конституционным законом.
Судьями Балтийского городского суда Калининградской области рассматриваются уголовные дела, гражданские, административные дела, материалы, дела об административных правонарушениях и жалобы граждан.
В 2005 году Управлением Судебного департамента в Калининградской области в Балтийском городском суде был произведен капитальный ремонт, в результате чего здание приобрело новый облик.
На смену председателя суда Осипова Виктора Сергеевича в 2005 году пришел Вагин Вадим Иванович, который на момент назначения более 4-х лет занимал должность судьи Балтийского городского суда (Указ Президента Российской Федерации от 19 декабря 2001 года № 1470). Вадим Иванович был назначен на должность председателя Балтийского городского суда Указом Президента РФ от 26 марта 2005 г. № 349, а впоследствии на основании Указа Президента Российской Федерации от 19 апреля 2011 г. № 466 он был повторно переназначен на эту же должность и проработал в суде до апреля 2016 года.
Упорядочение документов Балтийского городского суда было проведено в 2016 году. В результате упорядочения были составлены описи дел постоянного, временного сроков хранения и по личному составу.
Номенклатура дел суда впервые была составлена в 2008 году. В суде составлены описи постоянного срока хранения и по личному составу за 1948-2022 гг.
В период с апреля 2016 года по октябрь 2017 года обязанности председателя суда исполняли судьи: Дуденков Вадим Владимирович (с апреля 2016 года по май 2017 года) и Чолий Людмила Львовна (с мая 2017 года по октябрь 2017 года).
С октября 2017 года коллектив Балтийского городского суда Калининградской области возглавляет Переверзин Николай Витальевич, назначенный на должность председателя суда Указом Президента РФ от 23 октября 2017 г. № 506, имевший на момент назначения стаж работы в области юриспруденции 23 года, из которых в должности судьи – 14 лет.
На основании Указа Президента Российской Федерации от 08 ноября 2023 г. № 829 Николай Витальевич был повторно переназначен на должность председателя суда и работает в суде по настоящее время.
С 15 августа 2023 года штатная численность Балтийского городского суда Калининградской области составляет 21 единицу, из которых: 1 председатель суда, 3 судьи, 12 работников аппарата и 5 работников персонала по охране и обслуживанию зданий.